在消失一年后，中共西安市委原常委聂仲秋3月3日被陕西省纪委监委立案审查调查。这是聂仲秋落马消息首次披露。官方通报中，聂仲秋罕见被直接点出“违逆习近平有关秦岭违建别墅问题的批示”。
2020年3月2日，中共陕西省纪委监委宣布，西安市委原常委、市政府原党组成员聂仲秋被开除党籍、开除公职，并将其移送司法。
聂仲秋最后一次公开露面是在2019年2月17日上午，参加政协西安市第十四届委员会第三次会议闭幕。聂仲秋于去年7月被免去西安市委常委、市政府党组成员职务，8月辞去西安市人大代表职务。
陕西省纪委监委通报，聂仲秋被指涉“落实习近平关于秦岭北麓违建别墅问题重要指示批示不坚决、不彻底”以及“搞政治攀附，谋求个人职务升迁，对抗审查，订立攻守同盟，转移、隐匿证据”；“经济上贪婪，与私营企业主勾肩搭背，大搞权钱交易；“三观扭曲，生活腐化，道德败坏”等。
公开资料显示，年近52岁的聂仲秋是安徽寿县人，聂仲秋仕途起步于西安，2002年任西安灞桥区副区长，后任区长、区委书记，2013年调任长安区委书记，2015年任西安副市长，2017年任西安市委常委、市政府党组成员。期间，他在2013年至2015年担任长安区委书记。而长安区正是秦岭违建别墅问题最严重的地方，此前的两任区委书记钱引安、吕健，均已落马。
因习近平六次批示被地方官顶着不干的秦岭违建别墅案，引发2018年以来陕西官场遭大清洗。落马的官员包括陕西省委原书记赵正永、西安市委原书记魏民洲、陕西原副省长冯新柱、陕西省委原秘书长钱引安、陕西原副省长陈国强，西安原市长上官吉庆，西安原政协主席程群力等人。
值得注意的是，此前受秦岭别墅案牵出的官员，其落马通报中均未直接点出违逆习近平指示。
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